使通风柜提供的保护能力，使用者的正确操作是其重要因素。正确的操作和工作大降低污染物泄漏的可能性，延长通风柜的使用寿命。
1.
操作前检查
启动屋顶风机系统后，操作人员可以开始使用通风柜，使用通风柜前需要检查:
a.电源开关是否处于开启位置。
b.是否打开日光灯开关。
c.通风柜是否处于排风状态。
当所有检查结果都正常时，可以开始操作通风柜。
2.
正确的通风柜操作模式
a.玻璃窗全开状态只允许组装，调试内部仪器设备或清洁柜或清洁柜内空间时才允许出现。“调试状态”。
b.将玻璃窗调整到用户肘部（半开），使操作人员将手伸入柜内进行操作实验，胸部以上由玻璃窗安全钢化玻璃保护，为“正常运行状态”。
c.将门调整到开度，操作人员离开，使柜内的实验程序自行反应或暂停实验，这就是为什么“待机状态”。
d.在实验过程中，应避免将头部伸入通风柜调节门内，避免危险。
e.避免在通风柜内放置过多不必要的物品、设备，以免干扰空气的正常流动，造成干扰(湍流)流。
f.实验物品、设备放置在通风柜内时，应距离调节门内侧150mm保证排气顺畅。
g.操作人员在完成工作并离开通风柜前，应关闭通风柜内关闭所有水、电、气开关，将调节门降至位置。
h.虽然通风柜是聚合物耐腐蚀材料，但为了延长使用寿命，需要适当的清洁和维护。通常使用试剂时，药物飞溅应及时擦拭，清除，每天停止工作前，应用清水擦拭内部，每三个月至少清洗一次。
i.由于通风柜下方的柜子配备了电源控制箱，严禁放置任何腐蚀性物质，也不能挡住电源控制箱，以免发生危险。
j.每个通风柜都有电路保护系统(热继电器)+交流接触器双重保护)，总电源断路器(NFB)一个(附漏电保护)控制和保护风扇、风阀、灯具和插座。电源插座只提供10个电源插座A/220V使用规格，当设备总用电量超过10时A需要单独设计。
3.
正确放置设备和材料的位置
当设备或仪器放置在柜内时，其位置会影响通风柜内的气流形式。当操作人员站在通风柜前面时，会引起涡流。此时，如果操作人员前面的物品位置不正确，就会加重逆流和扰流。
为此提供几个参考建议：
a.设备应尽量靠近通风柜内部深处，并应至少距离调节门15至20厘米。
b.如因设备过长而伸出调节门，或放置位置足以影响调节门的开启或关闭。
c.当设备高度超过10厘米时，设备下方需要有气流通道，可以使用不锈钢支架提高设备，中空或孔支架可以减少对气流形式的干扰。
d.应避免在通风柜内放置过多的设备和仪器，通风柜内设备或其他设备的总面积不得超过台面板面积的50%。
e.如果通风柜需要使用电源设备或仪器，应更加注意接地，以减少火花产生的可能性。电源线应从下进气口拔出，外接电源插座和电源插座也应有完善和认证的接地设施。
f.柜内有高热负荷设备，其热源会引起柜内气流变化，影响通风柜玻璃窗开口下方的表面风速。热气流会增加玻璃窗开口下方的表面风速，降低开口上部的表面风速。
g.由于通风柜上方和调节门后面有逆流和涡流，应尽量避免在这两部分产生大量的气流扰动。
4.
操作员的位置和动作
a.通风柜操作人员应随时注意自身与通风柜的相对位置，因为污染物会聚集在通风柜所以操作人员在通风柜实验中不得随时将头伸入通风柜，这将造成污染空气流经操作人员的呼吸区。
b.当污染物开始在通风柜内产生时，操作人员必须慢慢接近或离开通风柜，因为快速移动会导致通风柜前开口附近的气流受到干扰，柜内的污染物带出。
c.操作人员还应避免在通风柜前快速挥动手臂和移动位置。
5.
垂直和水平拉门的正确位置
a.除必要外，垂直拉门应随时放在位置，以保护操作人员，减少调节门把手，阻挡操作人员的视线。通风柜的调节门只能在“调试状态”只放置在全开位置。
b.将调节门降至操作人员呼吸区以下，作用是建立人员与柜内污染物之间的隔离屏障，保护操作人员。
c.当空气进入水平调节门开口时，沿调节门垂直边缘产生涡流，涡流延伸到柜后面，将污染物带回调节门。因此，无论污染在哪里，它都会积聚在调节门附近。
d.虽然调节门可以在柜内飞溅或爆炸时保护操作人员，但必须记住调节门内污染物浓度值。一般来说，必须避免在调节门前快速移动。
e.避免快速从柜内取出物品或设备。
f.不使用通风柜时，应随时保持调节门在关闭位置。
6.
减少通风柜附近区域人员流量
当有人走过通风柜前方时，会产生大量的横向气流。因此，当柜内产生危险物质时，应通知实验室其他人员，限制人员通过通风柜前方或换道。
7.
确保通风柜干净
通风柜处理高毒性、高残留性或放射性物质时，应立即清洁通风柜内部，去除污染。
污染通风柜应挂明显警示标志，并告知维修人员哪些管道系统可能被污染，以免伤害维修人员。
108.
通风柜内不得存放任何物品
实验室通风柜不应作为替代化学储物柜储存化学物品，通风柜会因储存过多物品和有效工作空间而降低性能。
